Музей занимает здание Присустственных мест (1783) в глубине кремля, напротив «Тысячелетия России». Собственно, к этой дате и приурочено создание музея (1862–1865). Один из лучших музеев страны раскрывает всю историю Новгорода, но особенно интересно, разумеется, Средневековье. Например, коллекция берестяных грамот (а судя по их количеству и находкам, по сути дела, в древних свалках, грамотность в Новгороде была едва ли не поголовной), древнерусские музыкальные инструменты, актовые печати, новгородские ножи (а в Новгороде знали секрет самозатачивающейся стали), фрагменты волоков и многое другое. Второй этаж полностью посвящен новгородским иконам, среди которых «Петр и Павел» XI века, «Никола Липный» XIV века, единственная в своем роде икона (картина) «Битва новгородцев с суздальцами».