Представленная на экспозиции коллекция единственного в мире Музея В.В. Набокова формировалась в необычных условиях. После национализации дома и имущества семьи Набоковых в 1917 году наиболее ценная часть художественной коллекции и книжного собрания была передана в музеи и библиотеки России (в том числе Эрмитаж, Русский Музей, Российскую Национальную Библиотеку). К счастью, некоторая часть документов и фотографий сохранилась в зарубежных частных архивах родственников В.В. Набокова. Кроме того, часть предметов быта из дома Набоковых была сохранена в семьях петербуржцев, работавших в доме Набоковых.
Дмитрий Владимирович Набоков передал предметы писательского труда своего отца – карандаши, рабочие карточки с рукописями, пенсне, игру «Скрэббл» с автографами В.В. Набокова, а также сачок для ловли бабочек.
От Брайана Бойда поступили личные вещи В.В. Набокова (пиджак, куртка, ботинки), подаренные ему Верой Евсеевной Набоковой, вдовой писателя.
Уникальная коллекция первых изданий произведений В.В. Набокова, в том числе с автографами писателя, к нам поступила из частного собрания Терри Майерса (США).
Ценную часть собрания Музея В.В. Набокова составляет единственная в России коллекция бабочек В.В. Набокова, которая поступила от Н.А. Формозова (Москва). Эта коллекция была передана ему Музеем сравнительной зоологии Гарвардского университета (США), где В. Набоков работал в течение семи лет.