Где-то в глубинах Тихого океана военные обнаруживают гигантский космический корабль, покрытый трехсотлетним слоем кораллов. Предполагая инопланетное происхождение корабля, военные снаряжают экспедицию, которая смогла бы установить контакт с внеземной жизнью, возможно сохранившейся на корабле. В команду экспедиции помимо скрытного капитана-военного входят астрофизик, математик (Сэмюэль Л.Джексон), психолог (Дастин Хоффман) и биолог с суицидальными наклонностям (Шарон Стоун).
Спустившись на глубину в несколько сотен метров и проникнув на корабль, команда обнаруживает, что, во-первых, корабль не инопланетный, а вполне себе земной (родной американский), а во-вторых, что на корабле находится гигантская Сфера, которая как раз совершенно точно имеет инопланетное происхождение.
После того, как члены экспедиции поочередно вступают в контакт со Сферой, начинается всякая чертовщина - половина команды погибает, а оставшиеся ученые лихорадочно пытаются разобраться в ситуации, в друг друге, в Сфере и в куче других фак-апов, разом свалившихся к ним на голову.